學校緊緊圍繞科學前沿、國家戰略目標和區域重大需求，大力推進科研體制改革與創新，積極爭取大項目、凝聚大團隊、構筑大平臺、培育大成果、做出大貢獻，學校總體科技創新水平進入了國家隊行列，位居省內高校前列。“十二五”以來，承擔了一批國家級高層次科研項目，涵蓋了國家重點研發計劃、國家科技支撐計劃、“973”計劃、“863”計劃、國家科技重大專項、國家公益性行業科研專項、國家自然科學基金及國家社會科學基金等國家級項目；學校現有菌類作物優質高產抗病種質資源的挖掘、創制及應用學科創新引智基地，食用菌新種質資源創制國際聯合研究中心，小麥和玉米深加工國家工程實驗室，人參新品種選育與開發國家地方聯合工程研究中心，經濟菌物研究與利用國家地方聯合工程研究中心，動物生產及產品質量安全教育部重點實驗室，秸稈生物學與利用教育部重點實驗室，現代農業技術教育部國際合作聯合實驗室，國家作物種質資源長春觀測實驗站，國家農作物品種審定特性鑒定站等22個國家和部委級科研平臺，61個省級科研平臺。榮獲國家科學技術進步獎二等獎6項，省社科優秀成果獎一等獎11項，省科學技術獎一等獎28項，省科學技術獎獲獎數量和質量連續多年位居省屬高校首位。學校與60個市縣區（企業）簽訂了共建協議，組織學校科教人員開展支農服務，培訓各類技術人員、農民200余萬人次，創造技術增收200余億元，“把論文寫在吉林大地上”的辦學特色得到進一步彰顯。積極開展贊比亞農業技術示范中心援建工作，多次深入贊比亞各地開展農業技術服務，受到受援國及國家有關部委廣泛認可，成為南南合作典范。 （更新至2020年5月）
